La RUM se inicia en 1992, como un trabajo de cooperación entre sus fundadores para ofrecer programas académicos en conjunto y posteriormente se consolida mediante Acta de Constitución firmada el 4 de febrero de 1997, siendo integrada en ese momento por las siguientes entidades:

• Universidad Autónoma de Bucaramanga -UNAB
• Corporación Universitaria de Ibagué – CORUNIVERSITARIA
• Corporación Universitaria Autónoma de Occidente –CUAO
• Corporación Universitaria Tecnológica de Bolívar –CUTB
• Universidad Autónoma de Manizales –UAM
• Fundación Universitaria de Popayán –FUP

Desde comienzos de esta década, el Instituto Tecnológico de Monterrey invitó a Instituciones de Educación Superior Colombianas, a compartir algunas experiencias e innovaciones tecnológicas en materia de educación.

En sus primeros años la Red Mutis concentró sus esfuerzos en fortalecer los programas de investigación y la acreditación de los programas profesionales de sus miembros. A partir del año 2001 amplió su campo de acción a las áreas de internacionalización, promoviendo la movilidad de sus estudiantes y docentes; divulgación, creando el primer portal de la Red Mutis y universidad-empresa, mediante la conformación de una red de conocimiento.

Dentro del proceso de consolidación de la Red Mutis se permitió el ingreso de nuevos miembros y fue así como posteriormente entraron a formar parte de la RUM la Fundación Instituto Tecnológico Monterrey, en representación del ITESM de México, en Enero de 1998, la Fundación Suramericana de Medellín en Marzo de 1998, UNIMINUTO en Abril de 1998 y la Fundación Manuel Mejía en Abril de 2006.

• Actualmente la Red Universitaria Mutis, esta conformada por:
• Universidad Autónoma de Bucaramanga
• Universidad Autónoma de Occidente
• Universidad de Ibagué
• Universidad Tecnológica de Bolívar
• Universidad Autónoma de Manizales
• Corporación Universitaria Minuto de Dios,
• Fundación Instituto Tecnológico Monterrey sede Bogotá
• Tompkins Cortland Community College